RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 STXBP2Q15833 593 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TDHQ8IZJ6 230 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TOX2Q96NM4 488 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 RAG1P15918 1043 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CPT1AP50416 773 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 FGD1P98174 961 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 ARVCFO00192 962 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CTAGE5O15320 804 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CYTH3O43739 400 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 REC8O95072 547 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 POLR2MP0CAP2 368 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SMARCA1P28370 1054 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 HSD17B4P51659 736 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.62■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 RXRAP19793 462 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 BADQ92934 168 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 PXMP2Q9NR77 195 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 COL20A1Q9P218 1284 aa18.61■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 NR3C2P08235 984 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 MYL3P08590 195 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 PTGS1P23219 599 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 MICU3Q86XE3 530 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CUL5Q93034 780 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.6■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA0355O15063 1070 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 CDK7P50613 346 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 GHRHRQ02643 423 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 FAAP100Q0VG06 881 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGA7Q13683 1181 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 RASEFQ8IZ41 740 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 FANCBQ8NB91 859 aa18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
EFTUD2-215ENST00000589825 OPLAHO14841 1288 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 KPNA6O60684 536 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 GH1P01241 217 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 LTBP2Q14767 1821 aa18.58■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB43O43298 467 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CCND2P30279 289 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 LRIT3Q3SXY7 679 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 COPS5Q92905 334 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PDCD2LQ9BRP1 358 aa18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PSMA5P28066 241 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 HSPA4P34932 840 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PSMC6P62333 389 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 FPGSQ05932 587 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PGM5Q15124 567 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 LY6KQ17RY6 165 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 APOA5Q6Q788 366 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 A6NJR5 290 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms