RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 GHRHRQ02643 423 aa14.55□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 FERMT2Q96AC1 680 aa14.55□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.54□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 SEC24BO95487 1268 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.53□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.53□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 PHF24Q9UPV7 400 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 ALPK3Q96L96 1907 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 NR3C2P08235 984 aa14.52□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 FUT2Q10981 343 aa14.52□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 NID2Q14112 1375 aa14.51□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 A0A1W2PQY0 241 aa14.51□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.51□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.51□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.51□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.51□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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SMARCE1-218ENST00000582955 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.5□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 Q9Y3F1 56 aa14.5□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 PIK3CDO00329 1044 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 MEIS2O14770 477 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 CTAGE5O15320 804 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ZEB2O60315 1214 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 PPFIA3O75145 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ARIH2O95376 493 aa14.49□□□□□ -0.09
SMARCE1-218ENST00000582955 SYN1P17600 705 aa14.49□□□□□ -0.09
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