RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 MASTLQ96GX5 879 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SPATA32Q96LK8 384 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ABCC12Q96J65 1359 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PROCP04070 461 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NFICP08651 508 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PLCG1P19174 1290 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ZNF165P49910 485 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ST5P78524 1137 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PDE4BQ07343 736 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 CRY2Q49AN0 593 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 OLFM4Q6UX06 510 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 FBRSQ9HAH7 460 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 HTR3BO95264 441 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NPR1P16066 1061 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SOX9P48436 509 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DOC2BQ14184 412 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NFE2L2Q16236 605 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 VPS37DQ86XT2 251 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PPT2Q9UMR5 302 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ARID5AQ03989 594 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NFKBIBQ15653 356 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 NKG7Q16617 165 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 CCDC93Q567U6 631 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SOGA3Q5TF21 947 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 BEND4Q6ZU67 534 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SLC51AQ86UW1 340 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PASKQ96RG2 1323 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 FZD9O00144 591 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ATE1O95260 518 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 XP32Q5T750 250 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 HID1Q8IV36 788 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 KCT2Q8NC54 265 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 KLHL3Q9UH77 587 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 RAXQ9Y2V3 346 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 COL4A1P02462 1669 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-204ENST00000569773 HMX2A2RU54 273 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 DNAJA2O60884 412 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 NTSR2O95665 410 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 FGRP09769 529 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 MAP7Q14244 749 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-204ENST00000569773 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms