RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 ZBTB43O43298 467 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 ASGR1P07306 291 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 POLR2MP0CAP2 368 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 RXRAP19793 462 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 RCAN1P53805 252 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 PPP2R5BQ15173 497 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 STXBP2Q15833 593 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 COL20A1Q9P218 1284 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 ELP1O95163 1332 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 LTBP2Q14767 1821 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-211ENST00000565922 OPLAHO14841 1288 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TTLL4Q14679 1199 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PXMP2Q9NR77 195 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CABYRO75952 493 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 SYN1P17600 705 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 RTN1Q16799 776 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM60Q495X7 471 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 A0A1W2PPC1 479 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CPT1AP50416 773 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CUL5Q93034 780 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CTAGE5O15320 804 aa22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 BEX3Q00994 111 aa22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 FBXL16Q8N461 479 aa22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 NR3C2P08235 984 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 RPS6KB1P23443 525 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 BMP8BP34820 402 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 Q6ZUG5 572 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TOX2Q96NM4 488 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 GDF15Q99988 308 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 USP26Q9BXU7 913 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PRO3102Q9H379 93 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.91■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 TLE2Q04725 743 aa22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.89■■□□□ 1.26
CMTM3-211ENST00000565922 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 CLTBP09497 229 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 CCND2P30279 289 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 PGM5Q15124 567 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 BRF1Q92994 677 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.89■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 ARVCFO00192 962 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 PIK3CDO00329 1044 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 KPNA6O60684 536 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 CPA1P15085 419 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.88■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-211ENST00000565922 STAM2O75886 525 aa22.87■■□□□ 1.25
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