RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559961.1

SNX1-209, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 3

Gene SNX1, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-209ENST00000559961 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 DNAJB2P25686 324 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 TMEM240Q5SV17 173 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 CPVLQ9H3G5 476 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 ZBBXA8MT70 800 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 B4GALT4O60513 344 aa14.61□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.61□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 A6NJR5 290 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 CHMLP26374 656 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 CHST3Q7LGC8 479 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 HOMER1Q86YM7 354 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 MYLIPQ8WY64 445 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 HERVK_113Q902F9 699 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 ZNF576Q9H609 170 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 POLR2MP0CAP2 368 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-209ENST00000559961 PDE4AP27815 886 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 LAMC2Q13753 1193 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNX1-209ENST00000559961 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 TMTC2Q8N394 836 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 C7orf31Q8N865 590 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 AFG1LQ8WV93 481 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 COPS5Q92905 334 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 GRIN2DO15399 1336 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 KIF28PB7ZC32 967 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 E7EWF7 191 aa14.57□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 CYP2C9P11712 490 aa14.57□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.57□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 LTBP2Q14767 1821 aa14.57□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 PITPNM1O00562 1244 aa14.56□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 PTH1RQ03431 593 aa14.56□□□□□ -0.08
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SNX1-209ENST00000559961 GRIN2CQ14957 1233 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 GNPTABQ3T906 1256 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX1-209ENST00000559961 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.56□□□□□ -0.08
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