RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 MYADML2A6NDP7 307 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 PTGS1P23219 599 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 IWS1Q96ST2 819 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TMOD3-203ENST00000558455 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 GJA9P57773 515 aa24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PHF24Q9UPV7 400 aa24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 EVI5O60447 810 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 TLK2Q86UE8 772 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 FERMT2Q96AC1 680 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 IL17RAQ96F46 866 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 SPC25Q9HBM1 224 aa24.13■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 NR3C2P08235 984 aa24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 STXBP2Q15833 593 aa24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 ALPK3Q96L96 1907 aa24.12■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 CTAGE5O15320 804 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 NKX3-2P78367 333 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 KCNA10Q16322 511 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 IL31RAQ8NI17 732 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 SCFD2Q8WU76 684 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 CUL5Q93034 780 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 H0YGN5 161 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PIK3CDO00329 1044 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 MEIS2O14770 477 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 ACLYP53396 1101 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PGM5Q15124 567 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 Q9Y3F1 56 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.1■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 CEP290O15078 2479 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1W2PQY0 241 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 NAPAP54920 295 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 BEX3Q00994 111 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 GNASQ5JWF2 1037 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.09■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 STXBP3O00186 592 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 ARIH2O95376 493 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 TTLL4Q14679 1199 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 NTRK3Q16288 839 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PHKBQ93100 1093 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.08■■□□□ 1.45
TMOD3-203ENST00000558455 PPFIA3O75145 1194 aa24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 ASGR1P07306 291 aa24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 UBE2SQ16763 222 aa24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 COPS5Q92905 334 aa24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 BARHL2Q9NY43 387 aa24.07■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 SCG2P13521 617 aa24.06■■□□□ 1.44
TMOD3-203ENST00000558455 IFNAR1P17181 557 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms