RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557890.1

CYFIP1-201, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CYFIP1, Length 408 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-201ENST00000557890 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PPP6R2O75170 966 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TAF5LO75529 589 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SERPINC1P01008 464 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CMA1P23946 247 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 NT5C2P49902 561 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PTH1RQ03431 593 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PPP2R5BQ15173 497 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 Q6ZUG5 572 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RABGGTAQ92696 567 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 GOLGA1Q92805 767 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 C8orf76Q96K31 380 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 HAUS7Q99871 368 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MTA3Q9BTC8 594 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RNF208Q9H0X6 261 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CCDC151A5D8V7 595 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SPTLC2O15270 562 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 XBP1P17861 261 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CASQ1P31415 396 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 USP8P40818 1118 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 EVCP57679 992 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ATP2B3Q16720 1220 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 FERMT3Q86UX7 667 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MLKLQ8NB16 471 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 IL17REQ8NFR9 667 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RUBCNQ92622 972 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 EXOC4Q96A65 974 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 IQCDQ96DY2 449 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 EHD4Q9H223 541 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MEGF11A6BM72 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 KIF5CO60282 957 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CUTAO60888 179 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CIAO1O76071 339 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SLFN14P0C7P3 912 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ITPKAP23677 461 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MAPK1P28482 360 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 CYP2C19P33261 490 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 RCAN1P53805 252 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 UBASH3AP57075 661 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SPAG1Q07617 926 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PCDH1Q08174 1060 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 DSC3Q14574 896 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TNNI3KQ59H18 835 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 TMC6Q7Z403 805 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 SLC51AQ86UW1 340 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 NECAB1Q8N987 351 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 NCOA7Q8NI08 942 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 MED4Q9NPJ6 270 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 KIF1AQ12756 1690 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 LTN1O94822 1766 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-201ENST00000557890 NWD1Q149M9 1564 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms