RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	PHKB	Q93100	1093 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	VTA1	Q9NP79	307 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	MEIS2	O14770	477 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	COL6A1	P12109	1028 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	SMPD1	P17405	629 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE4D	Q08499	809 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	LRRC41	Q15345	812 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TPCN1-222	ENST00000552897	ADAMTS4	O75173	837 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	NEK4	P51957	841 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PKN1	Q16512	942 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	IL31RA	Q8NI17	732 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	MYADML2	A6NDP7	307 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	STXBP3	O00186	592 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	NR3C2	P08235	984 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	IFNAR1	P17181	557 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	TNFAIP2	Q03169	654 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	IWS1	Q96ST2	819 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PIK3CD	O00329	1044 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	DNM1L	O00429	736 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	CTAGE5	O15320	804 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	DTNB	O60941	627 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	SCRN1	Q12765	414 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	UBE2S	Q16763	222 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	BARHL2	Q9NY43	387 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	LARGE1	O95461	756 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	SCG2	P13521	617 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	NAPA	P54920	295 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PGM5	Q15124	567 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897		B4DLN1	442 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	PFKFB2	O60825	505 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	ARIH2	O95376	493 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	GJA9	P57773	515 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	STXBP2	Q15833	593 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TPCN1-222	ENST00000552897	ADAMTS3	O15072	1205 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	RGS20	O76081	388 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD1	Q15327	319 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ME3	Q16798	604 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	CUL5	Q93034	780 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	NKX3-2	P78367	333 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF180	Q86T96	592 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	NECAB1	Q8N987	351 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	COPS5	Q92905	334 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	SMCO2	A6NFE2	343 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	KBTBD13	C9JR72	458 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	BEX3	Q00994	111 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	TLK2	Q86UE8	772 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	SCFD2	Q8WU76	684 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	FERMT2	Q96AC1	680 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	PHF24	Q9UPV7	400 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	CPLX1	O14810	134 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	CTDNEP1	O95476	244 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	KCNA10	Q16322	511 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TPCN1-222	ENST00000552897	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04

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