RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 PRDM1O75626 825 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 EPHX2P34913 555 aa7.19□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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CMTM1-220ENST00000534143 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 KLF15Q9UIH9 416 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 TNKSO95271 1327 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 NMT2O60551 498 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 PFKFB2O60825 505 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 LGR5O75473 907 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 TSPY3P0CV98 308 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 TSPY8P0CW00 308 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-220ENST00000534143 EPXP11678 715 aa7.16□□□□□ -1.26
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