RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520489.5

BIN3-208, Transcript of bridging integrator 3, human

TSL 2

Gene BIN3, Length 3,589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BIN3-208	ENST00000520489	EPHB4	P54760	987 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	GRB10	Q13322	594 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	ECM1	Q16610	540 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	TLR10	Q9BXR5	811 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	STIM1	Q13586	685 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.77	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	USP17L21	D6R901	530 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	TRIM37	O94972	964 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	IRAK1	P51617	712 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	DDR1	Q08345	913 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PSME4	Q14997	1843 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489		H0YGN5	161 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SNAP23	O00161	211 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	GYS2	P54840	703 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	EVX2	Q03828	476 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	STK4	Q13043	487 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	FSBP	O95073	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CYP3A7	P24462	503 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	GGCX	P38435	758 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SIK1	P57059	783 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	NLRP5	P59047	1200 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	NAB2	Q15742	525 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489		B4DLN1	442 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PLCG1	P19174	1290 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	RASA1	P20936	1047 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	LMAN1	P49257	510 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	CEP72	Q9P209	647 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PRKCI	P41743	596 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	GABPA	Q06546	454 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BIN3-208	ENST00000520489	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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