RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520376.1

FBXW11-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 11, human

TSL 2

Gene FBXW11, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXW11-208	ENST00000520376	ZBTB43	O43298	467 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	NKX3-2	P78367	333 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	FGD1	P98174	961 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	TRIM60	Q495X7	471 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	PXMP2	Q9NR77	195 aa		28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
FBXW11-208	ENST00000520376	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	BEX3	Q00994	111 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376		Q9Y3F1	56 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	ASGR1	P07306	291 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	POLR2M	P0CAP2	368 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	RPS6KB1	P23443	525 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	PSMA5	P28066	241 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	RTN1	Q16799	776 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376		Q6ZUG5	572 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	SCFD2	Q8WU76	684 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	USP26	Q9BXU7	913 aa		28	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	RCAN1	P53805	252 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	BRF1	Q92994	677 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	APOBR	Q0VD83	1088 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	STXBP2	Q15833	593 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	PRO3102	Q9H379	93 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	NID2	Q14112	1375 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	ELP1	O95163	1332 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	27.96	■■■□□ 2.07	1e-10	■■■■□ 22.3
FBXW11-208	ENST00000520376	NR3C2	P08235	984 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FBXW11-208	ENST00000520376	ARIH2	O95376	493 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	PGM5	Q15124	567 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	FBXL16	Q8N461	479 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	IL31RA	Q8NI17	732 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	ZEB2	O60315	1214 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	TLE2	Q04725	743 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	GDF15	Q99988	308 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CDC27	P30260	824 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	FUT2	Q10981	343 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	RUFY3	Q7L099	469 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	COPS5	Q92905	334 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CUL5	Q93034	780 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CPT1A	P50416	773 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	PIK3CD	O00329	1044 aa		27.91	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CABYR	O75952	493 aa		27.91	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	CCND2	P30279	289 aa		27.91	■■■□□ 2.06
FBXW11-208	ENST00000520376	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		27.91	■■■□□ 2.06

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