RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	SV2C	Q496J9	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	MMP19	Q99542	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SUSD5	O60279	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ECI1	P42126	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760		B8ZZF3	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	GJB6	O95452	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NCAM1	P13591	858 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	LCP1	P13796	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FPR2	P25090	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	GRIA2	P42262	883 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CABP7	Q86V35	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	RELT	Q969Z4	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	C22orf46	C9J442	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PRRG2	O14669	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SGSM2	O43147	1006 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SASH1	O94885	1247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NAT2	P11245	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SLURP1	P55000	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	HTRA3	P83110	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ARID5A	Q03989	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NCAN	O14594	1321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	CAPNS1	P04632	268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	BCL6	P41182	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	KCNJ6	P48051	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	FXN	Q16595	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	CEP68	Q76N32	757 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	C8B	P07358	591 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	HOXC12	P31275	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	NFIX	Q14938	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	DIO2	Q92813	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQU0	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CDK1-208	ENST00000519760	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms