RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 B4DLN1 442 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 STRNO43815 780 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIB2Q92519 343 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ALG2Q9H553 416 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SAMM50Q9Y512 469 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RECKO95980 971 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MOGSQ13724 837 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 NECTIN1Q15223 517 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 APBA2Q99767 749 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 GINS2Q9Y248 185 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 KBTBD13C9JR72 458 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 COBLO75128 1261 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR2MP0CAP2 368 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2SQ16763 222 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CALM1P0DP23 149 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CALM2P0DP24 149 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CALM3P0DP25 149 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 TINF2Q9BSI4 451 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 USP26Q9BXU7 913 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.51□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ST18O60284 1047 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MYL3P08590 195 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PTGS1P23219 599 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ANTXR2P58335 489 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 BEX3Q00994 111 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 APOA5Q6Q788 366 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 GMCL1Q96IK5 515 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 C12orf42Q96LP6 360 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 DPH6Q7L8W6 267 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MKL1Q969V6 931 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BQV1 296 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB5O15062 677 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 XBP1P17861 261 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS6KB1P23443 525 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 HSPA4P34932 840 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 IFFO2Q5TF58 517 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PADI6Q6TGC4 694 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ARMCX2Q7L311 632 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 PHF12Q96QT6 1004 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 LY9Q9HBG7 655 aa7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ICAM1P05362 532 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RUFY3Q7L099 469 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CHST13Q8NET6 341 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ALG1Q9BT22 464 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.49□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SMCO2A6NFE2 343 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms