RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 MYADML2A6NDP7 307 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 ACLYP53396 1101 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 RCAN1P53805 252 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 KCNA10Q16322 511 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 IQSEC1Q6DN90 963 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 FBXL16Q8N461 479 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 PDGFCQ9NRA1 345 aa28.86■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 EDNRBP24530 442 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 GHRHRQ02643 423 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 SNX17Q15036 470 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM60Q495X7 471 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 GNASQ5JWF2 1037 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 TLK2Q86UE8 772 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 RMDN3Q96TC7 470 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.85■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 POLR2MP0CAP2 368 aa28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 CDC27P30260 824 aa28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 SEC24BO95487 1268 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 SMPD1P17405 629 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 C1orf53Q5VUE5 145 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGEF16Q5VV41 709 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 PRO3102Q9H379 93 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CXCL3-202ENST00000502974 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.82■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PXMP2Q9NR77 195 aa28.82■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 ASGR1P07306 291 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 ANAPC15P60006 121 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PPP2R5BQ15173 497 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 GDF15Q99988 308 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 NKX3-2P78367 333 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 BEX3Q00994 111 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 FUT2Q10981 343 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 IWS1Q96ST2 819 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 Q9Y3F1 56 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 NID2Q14112 1375 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PTGS1P23219 599 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 ELP1O95163 1332 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 A0A1W2PPC1 479 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 CTAGE5O15320 804 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 ZEB2O60315 1214 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 TLE2Q04725 743 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 STXBP2Q15833 593 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 C8orf34Q49A92 452 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 SCFD2Q8WU76 684 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 CUL5Q93034 780 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 NR3C2P08235 984 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 BMP8BP34820 402 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 EVCP57679 992 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PDCD2LQ9BRP1 358 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL3-202ENST00000502974 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL3-202ENST00000502974 PGM5Q15124 567 aa28.75■■■□□ 2.19
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