RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502676.1

PITX1-202, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-202ENST00000502676 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PXMP2Q9NR77 195 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PHF24Q9UPV7 400 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 MYADML2A6NDP7 307 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PPP2R5BQ15173 497 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 STXBP2Q15833 593 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 GNASQ5JWF2 1037 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 KLHDC9Q8NEP7 349 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 CDC27P30260 824 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 KCNA10Q16322 511 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 SCFD2Q8WU76 684 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 CUL5Q93034 780 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 A0A1W2PQY0 241 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 MOXD2PA6NHM9 499 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 NR3C2P08235 984 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 CST5P28325 142 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 ACLYP53396 1101 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 Q9Y3F1 56 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 ALPK3Q96L96 1907 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PTGS1P23219 599 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 RTP1P59025 263 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 ANAPC15P60006 121 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 BEX3Q00994 111 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-202ENST00000502676 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 ASGR1P07306 291 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 FUT2Q10981 343 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 TTLL4Q14679 1199 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 CTAGE5O15320 804 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 ZEB2O60315 1214 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 NKX3-2P78367 333 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 PGM5Q15124 567 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 SEC24BO95487 1268 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 CCND2P30279 289 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 EVCP57679 992 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 NID2Q14112 1375 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 PIK3CDO00329 1044 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 MEIS2O14770 477 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 SYN1P17600 705 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 NAPAP54920 295 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 TRIM60Q495X7 471 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 IL31RAQ8NI17 732 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 DNAH12Q6ZR08 3092 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 ARIH2O95376 493 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 SNX17Q15036 470 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 COPS5Q92905 334 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 ELP1O95163 1332 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 CPT1AP50416 773 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 LY6KQ17RY6 165 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.77■■□□□ 1.88
PITX1-202ENST00000502676 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms