RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 B4DLN1 442 aa20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 BFSP2Q13515 415 aa20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 NOD1Q9Y239 953 aa20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 KIF28PB7ZC32 967 aa20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF543Q08ER8 600 aa20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 TTC14Q96N46 770 aa20.44■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.43■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.43■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.43■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.43■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 FAM227BQ96M60 508 aa20.43■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 EPOPA6NHQ4 379 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 KCNQ1P51787 676 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 CHMP4BP1P59074 171 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 TAP1Q03518 808 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.42■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 A0A0D9SFI3 127 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 BAIAP3O94812 1187 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 ARIH2O95376 493 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 SNHG28P0DPA3 235 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 HAND2P61296 217 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 USH1GQ495M9 461 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 RGS22Q8NE09 1264 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 COG5Q9UP83 839 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 ZMYM6O95789 1325 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 ARHGEF15O94989 841 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 KCNJ6P48051 423 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 PTGISQ16647 500 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 KRT40Q6A162 431 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 SCN5AQ14524 2016 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 MUC3AQ02505 3323 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 MYO9BQ13459 2157 aa20.39■□□□□ 0.86
PKDCC-208ENST00000490302 PDE1AP54750 535 aa20.39■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CAGE1Q8TC20 777 aa20.39■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.39■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TLL1O43897 1013 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 GH1P01241 217 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TICAM2Q86XR7 235 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 AFG1LQ8WV93 481 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 MMP3P08254 477 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 GRB10Q13322 594 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 SESTD1Q86VW0 696 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 MAF1Q9H063 256 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CPVLQ9H3G5 476 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 LY6KQ17RY6 165 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D5Q92609 795 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 ESR2Q92731 530 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 HLA-CQ95604 372 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 ABCB11O95342 1321 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 SELPP16109 830 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 PLA2G5P39877 138 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 ARHGAP1Q07960 439 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CHST3Q7LGC8 479 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 DGKHQ86XP1 1220 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 FAM122AQ96E09 287 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.36■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 GPNMBQ14956 572 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 STXBP2Q15833 593 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 KAT2BQ92831 832 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 IWS1Q96ST2 819 aa20.35■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 LPXNO60711 386 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 DGKDQ16760 1214 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms