RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 RRAGAQ7L523 313 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CEP89Q96ST8 783 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM9Q9C026 710 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 FLT1P17948 1338 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 PAFAH1B1P43034 410 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 RASSF7Q02833 373 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 TRADDQ15628 312 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 TXNRD1Q16881 649 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 FIGNQ5HY92 759 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 MYH10P35580 1976 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.36□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 KIAA0754O94854 1291 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 LSP1P33241 339 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 SLC1A4P43007 532 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 MAGEA1P43355 309 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 GUCY2DQ02846 1103 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CFAP58Q5T655 872 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CABP7Q86V35 215 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 RUBCNQ92622 972 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 NUP98P52948 1817 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 TSPY2A6NKD2 308 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 FNTAP49354 379 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 SEC24CP53992 1094 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 EVA1CP58658 441 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 VWA3BQ502W6 1294 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 NDST4Q9H3R1 872 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 COL4A1P02462 1669 aa11.35□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 H0YHG0 523 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 M0R2N6 131 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 MYL1P05976 194 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 NAA35Q5VZE5 725 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 IQCKQ8N0W5 287 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 LCA5LO95447 670 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 FTCDO95954 541 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 TNFRSF8P28908 595 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC152Q4G0S7 254 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 IFT20Q8IY31 132 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CACNA1SQ13698 1873 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.34□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 ORC4O43929 436 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 NR1D1P20393 614 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 KIF5BP33176 963 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 BAP1Q92560 729 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 NOX5Q96PH1 765 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 GDF3Q9NR23 364 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 PAK2Q13177 524 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 LETM2Q2VYF4 491 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 KRT12Q99456 494 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 EPN3Q9H201 632 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.33□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 PALMO75781 387 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 FSBPO95073 299 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 TECP42680 631 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 PTGISQ16647 500 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 CABS1Q96KC9 395 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 CPVLQ9H3G5 476 aa11.32□□□□□ -0.6
VWA3B-217ENST00000489630 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms