RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484886.1

SNX17-206, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 2

Gene SNX17, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-206ENST00000484886 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX17-206ENST00000484886 IWS1Q96ST2 819 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX17-206ENST00000484886 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX17-206ENST00000484886 PXMP2Q9NR77 195 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX17-206ENST00000484886 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.08■■□□□ 1.13
SNX17-206ENST00000484886 ALPK3Q96L96 1907 aa22.08■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 H0YGN5 161 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 CDC27P30260 824 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 STXBP2Q15833 593 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 MYADML2A6NDP7 307 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 GJA9P57773 515 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 GHRHRQ02643 423 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PPP2R5BQ15173 497 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 GNASQ5JWF2 1037 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 FBXL16Q8N461 479 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 SCFD2Q8WU76 684 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PHF24Q9UPV7 400 aa22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 NR3C2P08235 984 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PTGS1P23219 599 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ANAPC15P60006 121 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 KCNA10Q16322 511 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 A0A1W2PQY0 241 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 SEC24BO95487 1268 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ACLYP53396 1101 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 NAPAP54920 295 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 BEX3Q00994 111 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 TTLL4Q14679 1199 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 CCND2P30279 289 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 RTP1P59025 263 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PGM5Q15124 567 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ZEB2O60315 1214 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ASGR1P07306 291 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 FUT2Q10981 343 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 Q9Y3F1 56 aa22.02■■□□□ 1.12
SNX17-206ENST00000484886 NID2Q14112 1375 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 STK3Q13188 491 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 IL31RAQ8NI17 732 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 CEP290O15078 2479 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 PIK3CDO00329 1044 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 CPLX1O14810 134 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 PPFIA3O75145 1194 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 SYN1P17600 705 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 UBE2SQ16763 222 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 TRIM60Q495X7 471 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 C8orf34Q49A92 452 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 COPS5Q92905 334 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 PHKBQ93100 1093 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 MEIS2O14770 477 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 CTAGE5O15320 804 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX17-206ENST00000484886 ADCY7P51828 1080 aa21.99■■□□□ 1.11
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