RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 Q9Y3F1 56 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RCAN1P53805 252 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 GHRHRQ02643 423 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TLK2Q86UE8 772 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CUL5Q93034 780 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZEB2O60315 1214 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ACLYP53396 1101 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXL16Q8N461 479 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SCFD2Q8WU76 684 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PXMP2Q9NR77 195 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MYADML2A6NDP7 307 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NR3C2P08235 984 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RTP1P59025 263 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PQY0 241 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.151e-6■□□□□ 11.1
SH3BP4-209ENST00000484097 ASGR1P07306 291 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 BEX3Q00994 111 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TTLL4Q14679 1199 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC27P30260 824 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NKX3-2P78367 333 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.22■■□□□ 1.15
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SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SYN1P17600 705 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CCND2P30279 289 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PGM5Q15124 567 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM60Q495X7 471 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CTAGE5O15320 804 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CABYRO75952 493 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PTGS1P23219 599 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 ANAPC15P60006 121 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 SNX17Q15036 470 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 ELP1O95163 1332 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PIK3CDO00329 1044 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CPT1AP50416 773 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 NAPAP54920 295 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 FUT2Q10981 343 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 COPS5Q92905 334 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 MEIS2O14770 477 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 EVCP57679 992 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 LY6KQ17RY6 165 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.17■■□□□ 1.14
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