RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PHF24Q9UPV7 400 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-211ENST00000480301 PTGS1P23219 599 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.461e-17■□□□□ 9.8
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R5BQ15173 497 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 IWS1Q96ST2 819 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 PXMP2Q9NR77 195 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE5O15320 804 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 EVI5O60447 810 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC15P60006 121 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 NKX3-2P78367 333 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 NID2Q14112 1375 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 NR3C2P08235 984 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 FERMT2Q96AC1 680 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 IL17RAQ96F46 866 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 Q9Y3F1 56 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 H0YGN5 161 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 STXBP2Q15833 593 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 KCNA10Q16322 511 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 SPC25Q9HBM1 224 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 ALPK3Q96L96 1907 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 C8orf34Q49A92 452 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 TLK2Q86UE8 772 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 PIK3CDO00329 1044 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 MEIS2O14770 477 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 ACLYP53396 1101 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 BEX3Q00994 111 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 PGM5Q15124 567 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 SCFD2Q8WU76 684 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQY0 241 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ARIH2O95376 493 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 NTRK3Q16288 839 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 GNASQ5JWF2 1037 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 IL31RAQ8NI17 732 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ASGR1P07306 291 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 TTLL4Q14679 1199 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 SNX17Q15036 470 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 CUL5Q93034 780 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 CEP290O15078 2479 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.452e-12■□□□□ 9.3
ACTB-211ENST00000480301 RGS20O76081 388 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 RTP1P59025 263 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 COPS5Q92905 334 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 BARHL2Q9NY43 387 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 STXBP3O00186 592 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 IFNAR1P17181 557 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 CCND2P30279 289 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PKN1Q16512 942 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 LY6KQ17RY6 165 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms