RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-215ENST00000479263 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 OPTNQ96CV9 577 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 RIPK3Q9Y572 518 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 UIMC1Q96RL1 719 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 COL20A1Q9P218 1284 aa24.44■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 FAM86B1E9PN63 330 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PRR29P0C7W0 189 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 UBXN2AP68543 259 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PPIL2Q13356 520 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.43■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CXCL11O14625 94 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CYP3A4P08684 503 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 SLFN14P0C7P3 912 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 TXLNAP40222 546 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 LENG9Q96B70 501 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 AK8Q96MA6 479 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.42■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 BIN1O00499 593 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CIITAP33076 1130 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 GJA5P36382 358 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 UBA7P41226 1012 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 GHRHRQ02643 423 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 POSTNQ15063 836 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 STX1AQ16623 288 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PRR16Q569H4 304 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 MYPNQ86TC9 1320 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 Q4G0T1 1027 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 IQUBQ8NA54 791 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 DISC1Q9NRI5 854 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PNMA2Q9UL42 364 aa24.41■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 POTEMA6NI47 508 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 OAZ1P54368 228 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 KANK3Q6NY19 840 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CABP7Q86V35 215 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PAGE5Q96GU1 130 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 RNF146Q9NTX7 359 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.4■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 MARCH6O60337 910 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 AFMP43652 599 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 MOGSQ13724 837 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ISM2Q6H9L7 571 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 LRRC15Q8TF66 581 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 PLIN2Q99541 437 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 USP25Q9UHP3 1055 aa24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PRKCZ-215ENST00000479263 ATP2A1O14983 1001 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 ZNF76P36508 570 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 ANO10Q9NW15 660 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PEX10O60683 326 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CASP1P29466 404 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 STAT6P42226 847 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PDIA5Q14554 519 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 STAMQ92783 540 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CBX8Q9HC52 389 aa24.38■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms