RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 TNKSO95271 1327 aa22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 RAD50Q92878 1312 aa22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 LCTP09848 1927 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 RAB30Q15771 203 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.51■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 CHMP4BP1P59074 171 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 TTLL4Q14679 1199 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 USP38Q8NB14 1042 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 PPM1EQ8WY54 764 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 KRT23Q9C075 422 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 ABCB11O95342 1321 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 A6NJR5 290 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 ZBBXA8MT70 800 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 KPNA6O60684 536 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 ARIH2O95376 493 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 RABGGTBP53611 331 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO11Q86XK2 927 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 COL20A1Q9P218 1284 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 LY6KQ17RY6 165 aa22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 VWCEQ96DN2 955 aa22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 RMDN3Q96TC7 470 aa22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 IL25Q9H293 177 aa22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 STXBP2Q15833 593 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 CHST3Q7LGC8 479 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 AFG1LQ8WV93 481 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 MAF1Q9H063 256 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-206ENST00000471526 CFBP00751 764 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 IGFBP4P22692 258 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 RETREG2Q8NC44 543 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 IWS1Q96ST2 819 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 NOD1Q9Y239 953 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 CDH23Q9H251 3354 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 GH1P01241 217 aa22.44■■□□□ 1.18
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SHQ1-206ENST00000471526 MYOGP15173 224 aa22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 ADGRE1Q14246 886 aa22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 EYSQ5T1H1 3165 aa22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 KLRF2D3W0D1 207 aa22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PDE4AP27815 886 aa22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 AMNQ9BXJ7 453 aa22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 MMP3P08254 477 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 IQCF3P0C7M6 154 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGAP1Q07960 439 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 SEC23AQ15436 765 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PTGISQ16647 500 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.42■■□□□ 1.18
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SHQ1-206ENST00000471526 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 NR3C2P08235 984 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 ACTN1P12814 892 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 RFC2P35250 354 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 TRDNQ13061 729 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 BFSP2Q13515 415 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 TTC22Q5TAA0 569 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PXMP2Q9NR77 195 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 PITPNM1O00562 1244 aa22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.4■■□□□ 1.18
SHQ1-206ENST00000471526 OPLAHO14841 1288 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 ZBTB5O15062 677 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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