RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464956.1

USP40-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 3

Gene USP40, Length 185 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-211ENST00000464956 GIPC1O14908 333 aa3.3□□□□□ -1.88
USP40-211ENST00000464956 PER2O15055 1255 aa3.3□□□□□ -1.88
USP40-211ENST00000464956 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
USP40-211ENST00000464956 ADCY6O43306 1168 aa3.3□□□□□ -1.88
USP40-211ENST00000464956 NBNO60934 754 aa3.3□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.3□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 LOC285556D6RIA3 1793 aa3.29□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
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USP40-211ENST00000464956 MYL3P08590 195 aa3.28□□□□□ -1.88
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