RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 UBE2SQ16763 222 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CENPPQ6IPU0 288 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 UNC13DQ70J99 1090 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 TTLL1O95922 423 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 KRT79Q5XKE5 535 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 EDIL3O43854 480 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SNHG28P0DPA3 235 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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IMP4-208ENST00000460766 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ABCB6Q9NP58 842 aa22.81■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 MYH1P12882 1939 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 RCCD1A6NED2 376 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 MAP2K7O14733 419 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ATP2B2Q01814 1243 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CYP27A1Q02318 531 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 RAD54LQ92698 747 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.79■■□□□ 1.24
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IMP4-208ENST00000460766 CYP2C19P33261 490 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 DDR1Q08345 913 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ZNF543Q08ER8 600 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SRGAP2O75044 1071 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 PDIA5Q14554 519 aa22.79■■□□□ 1.24
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IMP4-208ENST00000460766 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 HDXQ7Z353 690 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.79■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PQJ5 194 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SLC16A2P36021 539 aa22.78■■□□□ 1.24
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IMP4-208ENST00000460766 DDX12PQ92771 950 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB9Q96C00 473 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CCDC42Q96M95 316 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 NDST4Q9H3R1 872 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 USP40Q9NVE5 1235 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.78■■□□□ 1.24
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IMP4-208ENST00000460766 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ERCC3P19447 782 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 KCNK18Q7Z418 384 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 GJA10Q969M2 543 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 MXD3Q9BW11 206 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 COA1Q9GZY4 146 aa22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 SCNN1DP51172 638 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CERS5Q8N5B7 392 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 H3BQF6 201 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 CUL5Q93034 780 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 L1RE1Q9UN81 338 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-208ENST00000460766 LRRC41Q15345 812 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SPA17Q15506 151 aa22.76■■□□□ 1.23
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IMP4-208ENST00000460766 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 KCTD1Q719H9 257 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 MMS19Q96T76 1030 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SWAP70Q9UH65 585 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 EPHB6O15197 1021 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 KIF5AQ12840 1032 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 MAN2A1Q16706 1144 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 SP8Q8IXZ3 490 aa22.76■■□□□ 1.23
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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