RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 C8orf76Q96K31 380 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FGD4Q96M96 766 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM260Q9NX78 707 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 GABRQQ9UN88 632 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 KIF3AQ9Y496 699 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 ASTN1O14525 1302 aa11.76□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 POTEB2H3BUK9 544 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 M0R2N6 131 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 GNRH1P01148 92 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 GNA11P29992 359 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 CNTN2Q02246 1040 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PRKCZQ05513 592 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM29Q14134 588 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 GALNT17Q6IS24 598 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 BLIDQ8IZY5 108 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 SRRDQ9UH36 339 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MCM3APO60318 1980 aa11.75□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 HOXC6P09630 235 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 RGS2P41220 211 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FLT3LGP49771 235 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGEF6Q15052 776 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 BICD2Q8TD16 824 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 OXER1Q8TDS5 423 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 TNFRSF25Q93038 417 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 TAAR1Q96RJ0 339 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 APBA2Q99767 749 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 RPTORQ8N122 1335 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.74□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 IGHA2P01877 340 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 CYP2B6P20813 491 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PDCP20941 246 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 SYT1P21579 422 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 HOXD10P28358 340 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 KRT2P35908 639 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PRMT2P55345 433 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 AP3B2Q13367 1082 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 IRF5Q13568 498 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 DPP9Q86TI2 863 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MAML3Q96JK9 1138 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PGBD1Q96JS3 809 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PXMP2Q9NR77 195 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM17Q9Y577 477 aa11.73□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 BTBD18B2RXH4 712 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 NR5A1Q13285 461 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 CCL14Q16627 93 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MCTP2Q6DN12 878 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 DNERQ8NFT8 737 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MORC4Q8TE76 937 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 RMDN3Q96TC7 470 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 FAM205CA6NFA0 338 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 KIF28PB7ZC32 967 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 H3BQV1 296 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 EDNRBP24530 442 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 DDIT3P35638 169 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 IFFO2Q5TF58 517 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 IL31RAQ8NI17 732 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 TRIB2Q92519 343 aa11.71□□□□□ -0.53
GARNL3-211ENST00000460176 ANO3Q9BYT9 981 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms