RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PSMD1Q99460 953 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CABP5Q9NP86 173 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 SWAP70Q9UH65 585 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 BICDL2A1A5D9 508 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 GLI1P08151 1106 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 GNAT2P19087 354 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 DRD4P21917 467 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PAX7P23759 505 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MTMR3Q13615 1198 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FANCBQ8NB91 859 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 TLCD1Q96CP7 247 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 SH3GL3Q99963 347 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 NDST4Q9H3R1 872 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MYH10P35580 1976 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PDHBP11177 359 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MYL6BP14649 208 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 LRRC45Q96CN5 670 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ADORA1P30542 326 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MCAMP43121 646 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PPP2R2AP63151 447 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PPP2R5AQ15172 486 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 TTC38Q5R3I4 469 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PSMA7O14818 248 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 WFS1O76024 890 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FGRP09769 529 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FAM153BP0C7A2 387 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CCNE1P24864 410 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 KIF11P52732 1056 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FAM153CQ494X1 144 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CCDC42Q96M95 316 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 NOD2Q9HC29 1040 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ERICH2A1L162 156 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 E7EVH7 732 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ATP1A2P50993 1020 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 SEC24CP53992 1094 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 WTAPQ15007 396 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 IL17AQ16552 155 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 DCAF5Q96JK2 942 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 PLAAQ9Y263 795 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 A0A0G2JS52 829 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 MYZAPP0CAP1 466 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 RXRAP19793 462 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 CASP1P29466 404 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 NT5C2P49902 561 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-208ENST00000441439 ZNF844Q08AG5 666 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms