RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441124.5

HDLBP-218, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-218ENST00000441124 MYH4Q9Y623 1939 aa21.93■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 NFIBO00712 420 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 GJB5O95377 273 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 ICAM1P05362 532 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 SELPP16109 830 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 APPBP2Q92624 585 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.91■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.91■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.13e-7■■□□□ 11.9
HDLBP-218ENST00000441124 PLA2G6O60733 806 aa21.91■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 SCFD2Q8WU76 684 aa21.91■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 A6NJR5 290 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 M0R2C6 588 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 GNAT2P19087 354 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 SLC16A2P36021 539 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 GPNMBQ14956 572 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 TCTN1Q2MV58 587 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.9■■□□□ 1.1
HDLBP-218ENST00000441124 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.89■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.89■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.89■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.89■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 NBNO60934 754 aa21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 IKBKEQ14164 716 aa21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 ANKS1AQ92625 1134 aa21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 KCNH6Q9H252 994 aa21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TSPY2A6NKD2 308 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 NMT2O60551 498 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PPARAQ07869 468 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PTPROQ16827 1216 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TET1Q8NFU7 2136 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 AFG1LQ8WV93 481 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 FAM50BQ9Y247 325 aa21.87■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CKBP12277 381 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CHST3Q7LGC8 479 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 NEK9Q8TD19 979 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 NAPBQ9H115 298 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 MYH7P12883 1935 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 POTEB3A0JP26 581 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 EFCAB14O75071 495 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 ARIH2O95376 493 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CXCL10P02778 98 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 ZP2Q05996 745 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 POTEBQ6S5H4 581 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 INSL6Q9Y581 213 aa21.85■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 C7orf31Q8N865 590 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 BANK1Q8NDB2 785 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 ALG1Q9BT22 464 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PTPRSQ13332 1948 aa21.84■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 LCTP09848 1927 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 MMP3P08254 477 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 DCAF4Q8WV16 495 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 PHOX2BQ99453 314 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 INCENPQ9NQS7 918 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 CLDND1Q9NY35 253 aa21.83■■□□□ 1.09
HDLBP-218ENST00000441124 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.83■■□□□ 1.09
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