RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRJ-202ENST00000440289 EHHADHQ08426 723 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-202ENST00000440289 TRADDQ15628 312 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-202ENST00000440289 NLRP3Q96P20 1036 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-202ENST00000440289 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-202ENST00000440289 NDST4Q9H3R1 872 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-202ENST00000440289 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
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PTPRJ-202ENST00000440289 TRAPPC10P48553 1259 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRJ-202ENST00000440289 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 28.9
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PTPRJ-202ENST00000440289 THAP9Q9H5L6 903 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRJ-202ENST00000440289 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRJ-202ENST00000440289 IQCEQ6IPM2 695 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRJ-202ENST00000440289 FAM153CQ494X1 144 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 CREG2Q8IUH2 290 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 IRAK1P51617 712 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 AMPD3Q01432 767 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.22■□□□□ 0.83
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