RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GJA10Q969M2 543 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CSRNP1Q96S65 589 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYMKA6NI61 221 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 JAG1P78504 1218 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 HPS3Q969F9 1004 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 BICDL2A1A5D9 508 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GH2P01242 217 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC175P0C221 793 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC93Q567U6 631 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARID3AQ99856 593 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 FANCGO15287 622 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R2P41236 205 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNAP25P60880 206 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM14Q14142 442 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAD54LQ92698 747 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 V9GYY5 206 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 PES1O00541 588 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDUFB10O96000 172 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 DYMQ7RTS9 669 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA0895Q8NCT3 520 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GMCL1Q96IK5 515 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 LGALS16A8MUM7 142 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MB21D1Q8N884 522 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 EEF2KMTQ96G04 330 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANO3Q9BYT9 981 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABHD10Q9NUJ1 306 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM119Q4V9L6 283 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC13DQ70J99 1090 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNK18Q7Z418 384 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNG11P61952 73 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 COBLL1Q53SF7 1204 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 AMNQ9BXJ7 453 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADGRG1Q9Y653 693 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.24■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa28.24■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FECHP22830 423 aa28.24■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ECM1Q16610 540 aa28.24■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MEIS2O14770 477 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP11P51784 963 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTLL6Q8N841 843 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF507Q8TCN5 953 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 UIMC1Q96RL1 719 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAD17O75943 681 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 URI1O94763 535 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 BMP3P12645 472 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 USH1GQ495M9 461 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SYDE2Q5VT97 1194 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLRN2A0PK11 232 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPDYE6P0CI01 402 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT9P35527 623 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FBXO11Q86XK2 927 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMTC1Q8IUR5 882 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX12PQ92771 950 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDR24Q96S15 920 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC27Q9C0I9 530 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A1W2PQC6 194 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A1W2PRG0 241 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 B4DLN1 442 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 IDEP14735 1019 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CASQ1P31415 396 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 AP3B2Q13367 1082 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM114A1Q8IWE2 563 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERVK-24P63145 666 aa28.21■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.21■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSMD14O00487 310 aa28.2■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNM2P50570 870 aa28.2■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.2■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRN4CLQ8ND94 238 aa28.2■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 LZTFL1Q9NQ48 299 aa28.2■■■□□ 2.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ELF2Q15723 593 aa28.2■■■□□ 2.1
PLEKHF1-201ENST00000436066 CENPPQ6IPU0 288 aa28.2■■■□□ 2.1
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP26C1Q6V0L0 522 aa28.2■■■□□ 2.1
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.2■■■□□ 2.1
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