RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D5Q92609 795 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAAR1Q96RJ0 339 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IWS1Q96ST2 819 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.8■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLR2MP0CAP2 368 aa18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKX3-2P78367 333 aa18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TDHQ8IZJ6 230 aa18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.79■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYTH3O43739 400 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAG1P15918 1043 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RXRAP19793 462 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMARCA1P28370 1054 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSD17B4P51659 736 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MICU3Q86XE3 530 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOX2Q96NM4 488 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL20A1Q9P218 1284 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEP290O15078 2479 aa18.78■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARVCFO00192 962 aa18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CUL5Q93034 780 aa18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PXMP2Q9NR77 195 aa18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTAGE5O15320 804 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYL3P08590 195 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FANCBQ8NB91 859 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.76■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NR3C2P08235 984 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTGS1P23219 599 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GHRHRQ02643 423 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITGA7Q13683 1181 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BADQ92934 168 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.75■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OPLAHO14841 1288 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA0355O15063 1070 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB43O43298 467 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KPNA6O60684 536 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GH1P01241 217 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAAP100Q0VG06 881 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APOA5Q6Q788 366 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RASEFQ8IZ41 740 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.74■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCND2P30279 289 aa18.73■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSPA4P34932 840 aa18.73■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK7P50613 346 aa18.73■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RTN1Q16799 776 aa18.73■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDCD2LQ9BRP1 358 aa18.73■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMA5P28066 241 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FPGSQ05932 587 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PGM5Q15124 567 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COPS5Q92905 334 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LTBP2Q14767 1821 aa18.72■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.71■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.71■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHMP4BP1P59074 171 aa18.71■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMC6P62333 389 aa18.71■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LY6KQ17RY6 165 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms