RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 GHRHRQ02643 423 aa24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO11Q86XK2 927 aa24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 IWS1Q96ST2 819 aa24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 ACRP10323 421 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MYLIPQ8WY64 445 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR8Q96EF0 704 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MYL3P08590 195 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 CHMLP26374 656 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 TRDNQ13061 729 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 TIFAQ96CG3 184 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 COL20A1Q9P218 1284 aa24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 ARIH2O95376 493 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 FGBP02675 491 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 CYP21A2P08686 494 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 FOSL2P15408 326 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D5Q92609 795 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 AMNQ9BXJ7 453 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PBX4Q9BYU1 374 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF576Q9H609 170 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PFKMP08237 780 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B4P51659 736 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 STXBP2Q15833 593 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 COPS5Q92905 334 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 RMDN3Q96TC7 470 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.44■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 KLRF2D3W0D1 207 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 CCL23P55773 120 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 GRIN2CQ14957 1233 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 RAB30Q15771 203 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 VCANP13611 3396 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 OPLAHO14841 1288 aa24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB5O15062 677 aa24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PTH1RQ03431 593 aa24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PXMP2Q9NR77 195 aa24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PITPNM1O00562 1244 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 SGSM2O43147 1006 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 GH1P01241 217 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PBX2P40425 430 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP1Q07960 439 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF1Q13077 416 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 GRM4Q14833 912 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 VWCEQ96DN2 955 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 GBF1Q92538 1859 aa24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 ERICH2A1L162 156 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 CFBP00751 764 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 MMP3P08254 477 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2C9P11712 490 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 RFC2P35250 354 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 SESTD1Q86VW0 696 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 NCOA7Q8NI08 942 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-208ENST00000428064 E7EWF7 191 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 NR3C2P08235 984 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 LY6KQ17RY6 165 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SCLYQ96I15 445 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 MSRAQ9UJ68 235 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 TROAPQ12815 778 aa24.38■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 AFG1LQ8WV93 481 aa24.38■■□□□ 1.49
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