RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 FAM129CQ86XR2 697 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 USP33Q8TEY7 942 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 FRS2Q8WU20 508 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 DPF3Q92784 378 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 MARCH2Q9P0N8 246 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 SIRPGQ9P1W8 387 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 LRP2BPQ9P2M1 347 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 RFXAPO00287 272 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 ARNTLO00327 626 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 SRGAP3O43295 1099 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM13O60858 407 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 FUCA1P04066 466 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 ATF2P15336 505 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 FPR2P25090 351 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 GRIA2P42262 883 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 CORO7P57737 925 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 NR1I3Q14994 352 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 POMZP3Q6PJE2 187 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 EEPD1Q7L9B9 569 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC103Q8IW40 242 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 TEX2Q8IWB9 1127 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 SYT8Q8NBV8 401 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 COPS5Q92905 334 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 PWWP2AQ96N64 755 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 MTA3Q9BTC8 594 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PDPK1O15530 556 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NTRK1P04629 796 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 ASGR2P07307 311 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NAT2P11245 290 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 LCP1P13796 627 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 FBLN1P23142 703 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PMLP29590 882 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 KCNJ6P48051 423 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 SLC10A6Q3KNW5 377 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 MTERF2Q49AM1 385 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 LCE1DQ5T752 114 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 TCERG1LQ5VWI1 586 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 AMIGO3Q86WK7 504 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NPLOC4Q8TAT6 608 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 ALG3Q92685 438 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 SYT3Q9BQG1 590 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 SNTG2Q9NY99 539 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 A0A1B0GTL3 188 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NPHS1O60500 1241 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 HOXA5P20719 270 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 SERINC3Q13530 473 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 CABP7Q86V35 215 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NLGN2Q8NFZ4 835 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHO2Q8TD55 490 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 MKL1Q969V6 931 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PIF1Q9H611 641 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 C22orf46C9J442 243 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 AGRPO00253 132 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 FFAR3O14843 346 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PFKLP17858 780 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 BCL6P41182 706 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 FOXO4P98177 505 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 RASA3Q14644 834 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 LILRA6Q6PI73 481 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NLRP10Q86W26 655 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM145Q8NBT3 493 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 KREMEN2Q8NCW0 462 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 C20orf173Q96LM9 149 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 NOX5Q96PH1 765 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 MMP19Q99542 508 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-208ENST00000427110 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms