RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 RCAN1P53805 252 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 STXBP2Q15833 593 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PXMP2Q9NR77 195 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 Q9Y3F1 56 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 NR3C2P08235 984 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGS1P23219 599 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC27P30260 824 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 ACLYP53396 1101 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX3-2P78367 333 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R5BQ15173 497 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CTAGE5O15320 804 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 FUT2Q10981 343 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 TLK2Q86UE8 772 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQY0 241 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 BEX3Q00994 111 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 SCFD2Q8WU76 684 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 ASGR1P07306 291 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 RTP1P59025 263 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 EVCP57679 992 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL4Q14679 1199 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CUL5Q93034 780 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.33■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIS2O14770 477 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.481e-6■□□□□ 11.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ZEB2O60315 1214 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC24BO95487 1268 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX17Q15036 470 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 PGM5Q15124 567 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 MCM3APO60318 1980 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3CDO00329 1044 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 SYN1P17600 705 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ANAPC15P60006 121 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM60Q495X7 471 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 COPS5Q92905 334 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 LCTP09848 1927 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ELP1O95163 1332 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ARIH2O95376 493 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 LY6KQ17RY6 165 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CCND2P30279 289 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 IL31RAQ8NI17 732 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CABYRO75952 493 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 TLE2Q04725 743 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS20O76081 388 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 CPT1AP50416 773 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 NAPAP54920 295 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-204ENST00000416021 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.27■■□□□ 1.48
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