RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 CYBBP04839 570 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-209ENST00000415046 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-209ENST00000415046 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-209ENST00000415046 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-209ENST00000415046 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-209ENST00000415046 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-209ENST00000415046 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-209ENST00000415046 NEO1Q92859 1461 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-209ENST00000415046 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.71□□□□□ -1.33
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PTPRK-209ENST00000415046 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 AURKAO14965 403 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 SASH1O94885 1247 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 SHDQ96IW2 340 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 PWWP2AQ96N64 755 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 A0A1W2PQJ5 194 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 CAP1Q01518 475 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 SP8Q8IXZ3 490 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 RELTQ969Z4 430 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 STXBP3O00186 592 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 GRB10Q13322 594 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 NFIXQ14938 502 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 ABCA6Q8N139 1617 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRK-209ENST00000415046 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 PPM1BO75688 479 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 GLI4P10075 376 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 CASP7P55210 303 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 VMACQ2NL98 169 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 FGD4Q96M96 766 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 RNF38Q9H0F5 515 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-209ENST00000415046 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.66□□□□□ -1.34
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