RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE4DQ08499 809 aa17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 XBP1P17861 261 aa17.55■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9Y3F1 56 aa17.55■□□□□ 0.4
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPC25Q9HBM1 224 aa17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.54■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTDNEP1O95476 244 aa17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADCYAP1R1P41586 468 aa17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEPD1Q7L9B9 569 aa17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa17.53■□□□□ 0.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF180Q86T96 592 aa17.53■□□□□ 0.4
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