RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ASTN1O14525 1302 aa17.71■□□□□ 0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3CDO00329 1044 aa17.7■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PFKFB2O60825 505 aa17.7■□□□□ 0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 WDR11Q9BZH6 1224 aa17.66■□□□□ 0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.66■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.66■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 Q9Y3F1 56 aa17.66■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL4Q14679 1199 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PGM5Q15124 567 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ME3Q16798 604 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 BICD2Q8TD16 824 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF3C6Q969F1 213 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YGN5 161 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 HTATIP2Q9BUP3 242 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 PDGFCQ9NRA1 345 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LCTP09848 1927 aa17.64■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 PPFIA3O75145 1194 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 PGK1P00558 417 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 TXNP10599 105 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
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