RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 HTRA3P83110 453 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TCIRG1Q13488 830 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA5AQ13591 1074 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF1Q3BBV0 1214 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SAMD5Q5TGI4 173 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC85CA6NKD9 419 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 UBAP1LF5GYI3 381 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NBNO60934 754 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LAMC2Q13753 1193 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM87BQ96K49 555 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HHIPQ96QV1 700 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 EHD4Q9H223 541 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NCAPD2Q15021 1401 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ARNTLO00327 626 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PMM2O15305 246 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SNX2O60749 519 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TUSC2O75896 110 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 B3GALT4O96024 378 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LTFP02788 710 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CNGA1P29973 690 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PTGIRP43119 386 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NRLP54845 237 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 DDX11Q96FC9 970 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 VTA1Q9NP79 307 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MARK1Q9P0L2 795 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SLC12A7Q9Y666 1083 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PTCH1Q13635 1447 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TGM5O43548 720 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 VAMP4O75379 141 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CKMP06732 381 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HSD3B1P14060 373 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TNFAIP3P21580 790 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NME2P22392 152 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NR5A1Q13285 461 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 C4orf17Q53FE4 359 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NYAP1Q6ZVC0 841 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9A7Q96T83 725 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GDF15Q99988 308 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MEGF6O75095 1541 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FAM135BQ49AJ0 1406 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SHOXO15266 292 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO24O75426 580 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ACPPP15309 386 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RRM1P23921 792 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GPR3P46089 330 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PFKPQ01813 784 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 DEPTORQ8TB45 409 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TTC9Q92623 222 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MDFIQ99750 246 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 IFT22Q9H7X7 185 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FBRSQ9HAH7 460 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GMIPQ9P107 970 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GJA3Q9Y6H8 435 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TPP1O14773 563 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms