RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362425.1

RNU6-1312P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1312, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1312P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PROP1O75360 226 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ABHD16AO95870 558 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TGFB3P10600 412 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RHDQ02161 417 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SLC9A5Q14940 896 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZBTB37Q5TC79 503 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 KCNV1Q6PIU1 500 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF662Q6ZS27 426 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SLCO6A1Q86UG4 719 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TRIM50Q86XT4 487 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RFX6Q8HWS3 928 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ADHFE1Q8IWW8 467 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PARP9Q8IXQ6 854 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 IFNL2Q8IZJ0 200 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 LYZL4Q96KX0 146 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 C16orf92Q96LL3 132 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MLST8Q9BVC4 326 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ANLNQ9NQW6 1124 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 A0A1W2PQJ5 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CYP7B1O75881 506 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PLGP00747 810 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ITGB1P05556 798 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CBLP22681 906 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 IL13P35225 146 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CRHR2Q13324 411 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SEMA3AQ14563 771 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SLC9A4Q6AI14 798 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 LRP10Q7Z4F1 713 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF329Q86UD4 541 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 DTWD2Q8NBA8 298 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CAGE1Q8TC20 777 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TMEM63CQ9P1W3 806 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 IMPACTQ9P2X3 320 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 FTSJ1Q9UET6 329 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 FZD1Q9UP38 647 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 A0A1W2PQ27 194 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 A0A1W2PQ64 194 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 A0A1W2PQC6 194 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 A0A1W2PQD8 194 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 METTL12A8MUP2 240 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 IGFBP4P22692 258 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CXCR5P32302 372 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 AVPR1BP47901 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ATP1A2P50993 1020 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 Q6YL49 198 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PTF1AQ7RTS3 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CDH24Q86UP0 819 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CUZD1Q86UP6 607 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 FBXO41Q8TF61 875 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HMCESQ96FZ2 354 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MSL2Q9HCI7 577 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GJB4Q9NTQ9 266 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TLK1Q9UKI8 766 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TMEM82A0PJX8 343 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ADAM10O14672 748 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GRID2O43424 1007 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 C8BP07358 591 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 COL6A1P12109 1028 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CR2P20023 1033 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RPS19P39019 145 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF438Q7Z4V0 828 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SGMS1Q86VZ5 419 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HS3ST4Q9Y661 456 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 VEGFCP49767 419 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ITGA1P56199 1179 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RAC3P60763 192 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ETFDHQ16134 617 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF568Q3ZCX4 644 aa0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms