RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO40Q9UH90 709 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ERVK-9P63128 1117 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ERVK-24P63145 666 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 COL20A1Q9P218 1284 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 TRAK2O60296 914 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 NEMFO60524 1076 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 SLC25A27O95847 323 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 USP11P51784 963 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 EDIL3O43854 480 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 MBD3O95983 291 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ERCC3P19447 782 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 COPB2P35606 906 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 UBXN2AP68543 259 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 GPT2Q8TD30 523 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 WDR78Q5VTH9 848 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 CPA4Q9UI42 421 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 VEGFBP49765 207 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ADALQ6DHV7 355 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 POTEDQ86YR6 584 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 CLIC6Q96NY7 704 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 SLC37A4O43826 429 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CUTAO60888 179 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF76P36508 570 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CCNA1P78396 465 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 RMDN3Q96TC7 470 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PFASO15067 1338 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 LAD1O00515 517 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PTPREP23469 700 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 FERMT2Q96AC1 680 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MAF1Q9H063 256 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CYP3A4P08684 503 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 OR52Z1P0C646 297 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CALCRLQ16602 461 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MROH8Q9H579 483 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 RPTORQ8N122 1335 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 GRIN1Q05586 938 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 FSIP1Q8NA03 581 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PQ27 194 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PQ64 194 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PQD8 194 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 ALDH1A1P00352 501 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CYP3A7P24462 503 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CRHR2Q13324 411 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PRR16Q569H4 304 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PORCNQ9H237 461 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 EFCC1Q9HA90 598 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PXMP2Q9NR77 195 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 LCTP09848 1927 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MARCH6O60337 910 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 TLR2O60603 784 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CIITAP33076 1130 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CSRNP2Q9H175 543 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 FAM86B1E9PN63 330 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CA12O43570 354 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 MAP2K2P36507 400 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 PRPHP41219 470 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 KCTD2Q14681 263 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 SPECC1Q5M775 1068 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA4-201ENST00000360046 IL31RAQ8NI17 732 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms