RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 SLC1A4P43007 532 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 NAA25Q14CX7 972 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 CD302Q8IX05 232 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 HPS3Q969F9 1004 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.9■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 LPIN2Q92539 896 aa20.89■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.89■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.89■□□□□ 0.94
PRPF39-201ENST00000355765 RTL9Q8NET4 1388 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC53A6NM62 1247 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 SCTRP47872 440 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CDK17Q00537 523 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 RASGRF1Q13972 1273 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 EMC10Q5UCC4 262 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 LRRC15Q8TF66 581 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 P2RX5Q93086 422 aa20.89■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 PDE8BO95263 885 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 FCER1AP12319 257 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 DRP2Q13474 957 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ODF2Q5BJF6 829 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 RAD51CO43502 376 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 NOX5Q96PH1 765 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 GLI3P10071 1580 aa20.88■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 STK4Q13043 487 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ACCSLQ4AC99 568 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 MREGQ8N565 214 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 GGA2Q9UJY4 613 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 RHOBTB3O94955 611 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 MYZAPP0CAP1 466 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CHRNA2Q15822 529 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ESR2Q92731 530 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1W2PQJ5 194 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 PDE4DQ08499 809 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 PALMO75781 387 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CCNE1P24864 410 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 HSD17B3P37058 310 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 KCNB1Q14721 858 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TRAPPC3O43617 180 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 RCAN1P53805 252 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CRYMQ14894 314 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 PTPROQ16827 1216 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 WHAMMQ8TF30 809 aa20.86■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 UBA7P41226 1012 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 EHHADHQ08426 723 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.935e-7■■■■□ 22.8
PRPF39-201ENST00000355765 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1B0GUA9 196 aa20.84■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.84■□□□□ 0.93
PRPF39-201ENST00000355765 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms