RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 ADAM15Q13444 863 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 USP24Q9UPU5 2620 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 CYP2D6P10635 497 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 KIFC2Q96AC6 838 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 RAD50Q92878 1312 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 RB1P06400 928 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 FDX1P10109 184 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 CKBP12277 381 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 CDK8P49336 464 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 NDUFV1P49821 464 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 PTPN21Q16825 1174 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 TNNI3KQ59H18 835 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 MORC4Q8TE76 937 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 YME1L1Q96TA2 773 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 IGFLR1Q9H665 355 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 A6NJR5 290 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 F5H6K3 240 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 KLRC3Q07444 240 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 COASYQ13057 564 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 SESTD1Q86VW0 696 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 MEIS3Q99687 375 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 FEM1BQ9UK73 627 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX15-201ENST00000352068 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 LINC01565O15544 149 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 LGR5O75473 907 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 NDUFB10O96000 172 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ST3GAL2Q16842 350 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 TKFCQ3LXA3 575 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 GNAI3P08754 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 TOP1MTQ969P6 601 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 INCENPQ9NQS7 918 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 RNF146Q9NTX7 359 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 GRM6O15303 877 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 CTNNB1P35222 781 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 COL26A1Q96A83 441 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 CLEC1BQ9P126 229 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 NYAP2Q9P242 653 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 EMSYQ7Z589 1322 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 BMPR1AP36894 532 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 CHMP4BP1P59074 171 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 C12orf60Q5U649 245 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ZBTB33Q86T24 672 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 EFHBQ8N7U6 833 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 PTK7Q13308 1070 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 MBTPS1Q14703 1052 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 FIBCD1Q8N539 461 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX15-201ENST00000352068 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms