RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 BICDL2A1A5D9 508 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 AMPD3Q01432 767 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 KCNK18Q7Z418 384 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 FUT8Q9BYC5 575 aa18.26■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 USP40Q9NVE5 1235 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 RCCD1A6NED2 376 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SNHG28P0DPA3 235 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 GPIHBP1Q8IV16 184 aa18.25■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 AMPD2Q01433 879 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ECM1Q16610 540 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 LONRF2Q1L5Z9 754 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CNNM4Q6P4Q7 775 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 KCTD1Q719H9 257 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 C10orf67Q8IYJ2 551 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF543Q08ER8 600 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA3FQ13275 785 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 LACRTQ9GZZ8 138 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 EFCC1Q9HA90 598 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MYO6Q9UM54 1294 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 TTLL1O95922 423 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 IDEP14735 1019 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SHMT1P34896 483 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CYP27A1Q02318 531 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC41Q15345 812 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.24■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 LTBP1Q14766 1721 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 USP17L10C9JJH3 530 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2C19P33261 490 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MMP14P50281 582 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 MEA1Q16626 185 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CENPPQ6IPU0 288 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SP8Q8IXZ3 490 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC151A5D8V7 595 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM66O15016 1216 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SRGAP2O75044 1071 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 NFIAQ12857 509 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 NEK11Q8NG66 645 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 AFF2P51816 1311 aa18.23■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 EPHB6O15197 1021 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ATP8B1O43520 1251 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 RAD21O60216 631 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CTAGE8P0CG41 777 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 COA1Q9GZY4 146 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 RASSF4Q9H2L5 321 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 FAM196BA6NMK8 535 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 ZBED6P86452 979 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC96Q2M329 555 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 UNC13DQ70J99 1090 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1328Q86T90 577 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 CNPY4Q8N129 248 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 HAS1Q92839 578 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 YY1AP1Q9H869 796 aa18.22■□□□□ 0.51
SHQ1-201ENST00000325599 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms