RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 PENKP01210 267 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 KLC1Q07866 573 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF844Q08AG5 666 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 Q4G0T1 1027 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 LCA5Q86VQ0 697 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 GNAZP19086 355 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 COPB1P53618 953 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 CHADLQ6NUI6 762 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM7Q9C029 511 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 ABCF3Q9NUQ8 709 aa19.21■□□□□ 0.67
GLIS1-201ENST00000312233 DCDC2CA8MYV0 355 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 E7EWF7 191 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 SMAPO00193 183 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ASAP2O43150 1006 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TCP1P17987 556 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MSH2P43246 934 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TRADDQ15628 312 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CMPK2Q5EBM0 449 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MFSD4BQ5TF39 518 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 A0A0G2JLW4 131 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ATP11AP98196 1134 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 GALNT17Q6IS24 598 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 LINS1Q8NG48 757 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ECT2Q9H8V3 914 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TAB2Q9NYJ8 693 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CACNA1FO60840 1977 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 UBOX5O94941 541 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF24P17028 368 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 RPL13P26373 211 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 HSD17B3P37058 310 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 PAFAH1B1P43034 410 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 GRIN1Q05586 938 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 STK38LQ9Y2H1 464 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 HYOU1Q9Y4L1 999 aa19.2■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 BRINP3Q76B58 766 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 KIF2BQ8N4N8 673 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MTRQ99707 1265 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 COBLO75128 1261 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 DESP17661 470 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 KIF5AQ12840 1032 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 AGBL2Q5U5Z8 902 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 FAM114A1Q8IWE2 563 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MYH7P12883 1935 aa19.19■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MDM1Q8TC05 714 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 AIFM3Q96NN9 605 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 SLAIN2Q9P270 581 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TMCO1Q9UM00 188 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 HIP1RO75146 1068 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 FLOT1O75955 427 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 CYP27A1Q02318 531 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 KLHL29Q96CT2 875 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGEF3Q9NR81 526 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 HPS5Q9UPZ3 1129 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.17■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 TACC1O75410 805 aa19.17■□□□□ 0.66
GLIS1-201ENST00000312233 LONP2Q86WA8 852 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms