RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306666.9

PTGER3-201, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-201ENST00000306666 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SLC35F6Q8N357 371 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 GOLGA1Q92805 767 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PNMA5Q96PV4 448 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 RAB34Q9BZG1 259 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 STK17AQ9UEE5 414 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MCM6Q14566 821 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 TTLL6Q8N841 843 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 HPS3Q969F9 1004 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 DNAJC7Q99615 494 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CDC23Q9UJX2 597 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CTAGE9A4FU28 777 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 NDUFA10O95299 355 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ARHGAP25P42331 645 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CRKP46108 304 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PDIA5Q14554 519 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 UBE2SQ16763 222 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CCDC96Q2M329 555 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 POTEMA6NI47 508 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MYMKA6NI61 221 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 DPEP1P16444 411 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SLC16A2P36021 539 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 RABGGTAQ92696 567 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KCTD1Q719H9 257 aa20.61■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 NFIAQ12857 509 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 TUBB2AQ13885 445 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KRT79Q5XKE5 535 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 UNC13DQ70J99 1090 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CUL5Q93034 780 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 NUP58Q9BVL2 599 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MRIQ9BWK5 157 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 WDR59Q6PJI9 974 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 DYMQ7RTS9 669 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CEP112Q8N8E3 955 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 YDJCA8MPS7 323 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 USP17L10C9JJH3 530 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ZBTB5O15062 677 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SLURP2P0DP57 97 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CHMP4BP1P59074 171 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 CENPPQ6IPU0 288 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PPIP5K2O43314 1243 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 RAD54LQ92698 747 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 RASSF10A6NK89 507 aa20.58■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 KLK7P49862 253 aa20.58■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 MIIPQ5JXC2 388 aa20.58■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 RETREG2Q8NC44 543 aa20.58■□□□□ 0.89
PTGER3-201ENST00000306666 ZBTB7AO95365 584 aa20.58■□□□□ 0.88
PTGER3-201ENST00000306666 MTMR8Q96EF0 704 aa20.58■□□□□ 0.88
PTGER3-201ENST00000306666 CCDC17Q96LX7 622 aa20.58■□□□□ 0.88
PTGER3-201ENST00000306666 EHD4Q9H223 541 aa20.58■□□□□ 0.88
PTGER3-201ENST00000306666 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.58■□□□□ 0.88
PTGER3-201ENST00000306666 MEA1Q16626 185 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms