RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299441.4

DCHS1-201, Transcript of dachsous cadherin-related 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DCHS1, Length 10,765 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1-201ENST00000299441 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 CLIC2O15247 247 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 MTMR3Q13615 1198 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 KRT3P12035 628 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 PHKG2P15735 406 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 GCNT4Q9P109 453 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 TSKSQ9UJT2 592 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 MYL3P08590 195 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 KMT5AQ9NQR1 393 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 ACTN1P12814 892 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 EHHADHQ08426 723 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.22■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 CD58P19256 250 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 PTPREP23469 700 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 SERPINB6P35237 376 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 CNKSR1Q969H4 720 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 NLRP4Q96MN2 994 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 CCNYQ8ND76 341 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 RCN2Q14257 317 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 METTL23Q86XA0 190 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 TFDP1Q14186 410 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 A0A087WWV3 80 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 ARHGAP6O43182 974 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 COG7P83436 770 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa15.21■□□□□ 0.03
DCHS1-201ENST00000299441 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.21■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.21■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 RETREG2Q8NC44 543 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 RXRBP28702 533 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 SCRN1Q12765 414 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 KCTD6Q8NC69 237 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 OPHN1O60890 802 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 LRRC41Q15345 812 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 MUM1Q2TAK8 710 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ITSN1Q15811 1721 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 HOXB7P09629 217 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 BTBD18B2RXH4 712 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L8P0C7I0 530 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ZNF853P0CG23 659 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 KRT33BQ14525 404 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 LMNB1P20700 586 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ATP10DQ9P241 1426 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.2■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 SZRD1Q7Z422 152 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 BAG5Q9UL15 447 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CCNA1P78396 465 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 PFDN6O15212 129 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CXCR5P32302 372 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 COA7Q96BR5 231 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 IQCB1Q15051 598 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 HACD3Q9P035 362 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 MTERF2Q49AM1 385 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 EXT2Q93063 718 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 FANCLQ9NW38 375 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CITO14578 2027 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 H0YCG3 227 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 TUBBP07437 444 aa15.19■□□□□ 0.02
DCHS1-201ENST00000299441 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms