RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 STK17AQ9UEE5 414 aa29.39■■■□□ 2.3
FOXQ1-201ENST00000296839 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FOXQ1-201ENST00000296839 CDKAL1Q5VV42 579 aa29.39■■■□□ 2.3
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM160B2Q86V87 743 aa29.39■■■□□ 2.3
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC150Q8NCX0 1101 aa29.39■■■□□ 2.3
FOXQ1-201ENST00000296839 MARCH6O60337 910 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 PAK1Q13153 545 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT79Q5XKE5 535 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SNX29Q8TEQ0 813 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 KCNMB3Q9NPA1 279 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 HACL1Q9UJ83 578 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SPDYE3A6NKU9 549 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 PRCPP42785 496 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 AMPD3Q01432 767 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 GJA10Q969M2 543 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 KIFC2Q96AC6 838 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.38■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 PIK3CDO00329 1044 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SREBF1P36956 1147 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 NELFBQ8WX92 580 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 FEM1BQ9UK73 627 aa29.37■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SKILP12757 684 aa29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC174Q6PII3 467 aa29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 TEX2Q8IWB9 1127 aa29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 ADSSL1Q8N142 457 aa29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SV2BQ7L1I2 683 aa29.35■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 FEZ1Q99689 392 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 GINM1Q9NU53 330 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1B0GTH6 734 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 COBLO75128 1261 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 ASIC1P78348 528 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 Q4G0T1 1027 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 RAD54LQ92698 747 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.34■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 MCM6Q14566 821 aa29.33■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 NR1I3Q14994 352 aa29.33■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.33■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
FOXQ1-201ENST00000296839 CIITAP33076 1130 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 PTPN21Q16825 1174 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 ETNPPLQ8TBG4 499 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 EXOC1Q9NV70 894 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 ECM1Q16610 540 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 PRR16Q569H4 304 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 HYIQ5T013 277 aa29.32■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 DOCK1Q14185 1865 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 TBX3O15119 743 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 CYP3A4P08684 503 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 PDE4DQ08499 809 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 STIM1Q13586 685 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 LENG9Q96B70 501 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 MYMKA6NI61 221 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 KCNK18Q7Z418 384 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 UIMC1Q96RL1 719 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM86B1E9PN63 330 aa29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC26A4O43511 780 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 CFBP00751 764 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 INPP5BP32019 993 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 TBC1D5Q92609 795 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCB11O95342 1321 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 H7C1D1 291 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 LPAR1Q92633 364 aa29.29■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 POLR2MP0CAP2 368 aa29.28■■■□□ 2.28
FOXQ1-201ENST00000296839 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms