RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.83■■■□□ 2.21
CXCL2-201ENST00000296031 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PXMP2Q9NR77 195 aa28.82■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.82■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 EVI5O60447 810 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 SMPD1P17405 629 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 SPC25Q9HBM1 224 aa28.81■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 GJA9P57773 515 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 C8orf34Q49A92 452 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 FERMT2Q96AC1 680 aa28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 NID2Q14112 1375 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 MYADML2A6NDP7 307 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PTGS1P23219 599 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 STXBP2Q15833 593 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 TLK2Q86UE8 772 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 IL17RAQ96F46 866 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.79■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 NR3C2P08235 984 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 CUL5Q93034 780 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PHF24Q9UPV7 400 aa28.78■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 SCFD2Q8WU76 684 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PDCD2LQ9BRP1 358 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 Q9Y3F1 56 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.77■■■□□ 2.2
CXCL2-201ENST00000296031 PIK3CDO00329 1044 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 NKX3-2P78367 333 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 KCNA10Q16322 511 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CEP290O15078 2479 aa28.76■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 H0YGN5 161 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 MEIS2O14770 477 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ACLYP53396 1101 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 BEX3Q00994 111 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PGM5Q15124 567 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 GNASQ5JWF2 1037 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PQY0 241 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CTAGE5O15320 804 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 IL31RAQ8NI17 732 aa28.74■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 NAPAP54920 295 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 TTLL4Q14679 1199 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 NTRK3Q16288 839 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ASGR1P07306 291 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CCND2P30279 289 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 STK3Q13188 491 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PHKBQ93100 1093 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 BARHL2Q9NY43 387 aa28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 STXBP3O00186 592 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 PPFIA3O75145 1194 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ARIH2O95376 493 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 IFNAR1P17181 557 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 RTP1P59025 263 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2SQ16763 222 aa28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.2 ms