RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FBXO3Q9UK99 471 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ADSSL1Q8N142 457 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TMOD1P28289 359 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 LSP1P33241 339 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 AMPD2Q01433 879 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MGARPQ8TDB4 240 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.88■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 THAP9Q9H5L6 903 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ANO9A1A5B4 782 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 CHRNDQ07001 517 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KRT79Q5XKE5 535 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 G3V3G9 751 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KAT2BQ92831 832 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 RAB34Q9BZG1 259 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PPP2R5BQ15173 497 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ALS2CLQ60I27 953 aa16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 LRRC37A3O60309 1634 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PPP2R5AQ15172 486 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TXNRD1Q16881 649 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 NLRP14Q86W24 1093 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.295e-7■■■■□ 21.1
USP25-201ENST00000285679 ADCY1Q08828 1119 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KRIT1O00522 736 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FAM153BP0C7A2 387 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ABCB4P21439 1286 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SNCBQ16143 134 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FAM153CQ494X1 144 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 WDR59Q6PJI9 974 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 VPS36Q86VN1 386 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.86■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SMCO2A6NFE2 343 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PPP1R37O75864 691 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KCNQ4P56696 695 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 VEZTQ9HBM0 779 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 OR52Z1P0C646 297 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 C6orf50Q9HD87 102 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MYH8P13535 1937 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 USP17L3A6NCW0 530 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 USP17L4A6NCW7 530 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PBX1P40424 430 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PEX26Q7Z412 305 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 KLC4Q9NSK0 619 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.85■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 F8W031 263 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SRGNP10124 158 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 NEDD9Q14511 834 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PKN1Q16512 942 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ASIC2Q16515 512 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 RPAINQ86UA6 219 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 LRRC45Q96CN5 670 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 GGT7Q9UJ14 662 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 GLI1P08151 1106 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 USP17L8P0C7I0 530 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SLCO1A2P46721 670 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 VWA3BQ502W6 1294 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms