RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 CXorf38Q8TB03 319 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 M0R2C6 588 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 WHAMMQ8TF30 809 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 P2RX5Q93086 422 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 MYO1FO00160 1098 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 RESTQ13127 1097 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 PDCLQ13371 301 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 EPC1Q9H2F5 836 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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SBNO1-201ENST00000267176 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 RNF14Q9UBS8 474 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 KCNA6P17658 529 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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SBNO1-201ENST00000267176 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.9□□□□□ -1.3
SBNO1-201ENST00000267176 KIF11P52732 1056 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 MMEL1Q495T6 779 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 AK8Q96MA6 479 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 PPFIA2O75334 1257 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 SLFN14P0C7P3 912 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 INTUQ9ULD6 942 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.9□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 LMNB1P20700 586 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 SAT1P21673 171 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 EMBQ6PCB8 327 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 SPDL1Q96EA4 605 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 MMEP08473 750 aa6.89□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 MAN2A1Q16706 1144 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 GALNT17Q6IS24 598 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 HAUS1Q96CS2 278 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.89□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 TEKT1Q969V4 418 aa6.89□□□□□ -1.31
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SBNO1-201ENST00000267176 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-201ENST00000267176 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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