RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262640.11

VAMP7-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 7, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP7, Length 2,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7-201ENST00000262640 CIITAP33076 1130 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP7-201ENST00000262640 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
VAMP7-201ENST00000262640 PDILTQ8N807 584 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP7-201ENST00000262640 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP7-201ENST00000262640 PTPRFP10586 1907 aa14.72□□□□□ -0.05
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VAMP7-201ENST00000262640 Q4G0T1 1027 aa14.71□□□□□ -0.05
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VAMP7-201ENST00000262640 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 26.6
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VAMP7-201ENST00000262640 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.68□□□□□ -0.06
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VAMP7-201ENST00000262640 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 STAT6P42226 847 aa14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 PLS1Q14651 629 aa14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 NSMFQ6X4W1 530 aa14.67□□□□□ -0.06
VAMP7-201ENST00000262640 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.67□□□□□ -0.06
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